為讓民眾瞭解海灘水質，做為親水活動參考，本署自民國88年起，於夏日泳季6~9月期間進行監測，91至97年監測範圍為臺灣本島10處海灘，98年擴及澎湖、金門、馬祖等共13處海灘。經99年2月11日邀集交通部觀光局、相關風景區管理處、各縣(市)政府環保局共同研商結果，選擇戲水遊客較多的海灘，並刪除未營運管理之大安海水浴場及崎頂海水浴場，擴增後為23處海灘(如表1、圖1)，監測期間增為3個月(即6至8月)，監測頻率為7、8月每週1次，6月底預監測1次，全年計約10次。資料發布分級方式則分為「優良」、「普通」、「不宜親水活動」等3級。

     海灘水質採樣原則：於該海灘水域安全索範圍內，左、中、右各一處，水深約1公尺處採集水樣，每次採樣同時拍照記錄海灘環境及水色等現場資訊，上網提供民眾參考。